Ninja Assassin ติดตามไรโซ่ (เรน) หนึ่งในบรรดามือสังหารมือพระรอยดำของโลก เขาโดนจับตัวไปตั้งแต่ยังเด็ก แล้วก็ถูกทำให้เปลี่ยนเป็นมือสังหารมือโปรโดย โอซูนุ แคลุกลี้ลุกลน กับกรุ๊ปลับที่เช้าใจกันว่ามีเพียงแค่ในเรื่องปรัมปรา แม้กระนั้นเขาถูกหลอนด้วยการที่แคลุกลี้ลุกลนฆ่าเพื่อนพ้องของเขาอย่างโหดเหี้ยม ไรโซ่จึงหนีพวกเขาไปสู่อิสรภาพแล้วก็ล่องหนไป ในเวลานี้เขาคอย แล้วก็เตรียมที่จะลงมือเอาคืน ในเบอร์ลิน สายสืบยูโรโพล มิค่า คอเรตตำหนิ (ทุ่งนาโอมี แฮร์ริส) สะดุดกับร่องรอยของเงินที่โยงการฆาตกรรมด้านการเมืองกับเครือข่ายใต้ดินของพวกมือสังหารที่ไร้ร่องรอยจากตะวันออกไกล มิค่าท้าคำสั่งของไรอัน แมสโลว์ (เบน ไมล์ส) ซึ่งเป็นหัวหน้า คุณขุดลึกลงไปในแฟ้มลับยอดเยี่ยมเพื่อได้ทราบถึงเรื่องจริงเบื้องหน้าเบื้องหลังการฆาตกรรม การสืบสวนที่ทำให้คุณตกเป็นเป้าหมาย แล้วก็โอซูนุ แคลุกลี้ลุกลนส่งทีมมือสังหาร ซึ่งนำโดยทาเคชิ (ริค ยูน) มาเพื่อปิดปากคุณตลอดไป ไรโซ่ช่วยมิค่าจากบรรดาผู้ปองร้าย แม้กระนั้นเขาทราบว่าแคลุกลี้ลุกลนจะไม่มีทางอยู่กับที่ตราบจนกระทั่งเขาทั้งสองจะถูกกำจัด ด้วยชีวิตที่ห้อยอยู่กับเกมแมวไล่หนูตามถนนหนทางของยุโรป ไรโซ่แล้วก็มิค่าจำเป็นที่จะต้องวางใจกันและกันถ้าหากยังหวังจะเอาชีวิตรอด …แล้วก็ล้มล้างโอซูนุ แคลุกลี้ลุกลนผู้ลึกลับลงให้สำเร็จ
